تعتبر الكنيسة القبطية الأرثوذكسية في مصر من أبرز المؤسسات التي تهتم بالتعليم والتربية، حيث تضم العديد من الهيئات التعليمية التي تسعى إلى إعداد جيل واعٍ ومثقف ملتزم بهويته القبطية والمسيحية، من بين هذه الهيئات: الكلية الإكليريكية بالأنبا رويس: وهي كلية متخصصة في إعداد الكهنة والرعاة الكنسيين، وتقدم برامج تعليمية تهدف إلى تطوير القدرات الروحية والعلمية للطلاب. المعهد القبطي للتدبير الكنسي والتنمية: يركز المعهد على تدريب وتأهيل الكوادر الكنسية في مجالات الإدارة والتنمية لخدمة الكنيسة والمجتمع. معهد الرعاية والتربية: معهد كنسي قبطي أرثوذكسي يعمل على إعداد رعاة كنسيين مفكرين وقادرين على ممارسة العمل الرعوي بكفاءة عالية، ملتزمين بمسؤولية الرعاية. الأكاديمية الأوروبية للتراث القبطي: تهدف إلى الحفاظ على التراث القبطي ونشره، وتقديم برامج تعليمية وبحثية في مجالات الثقافة والتاريخ القبطي. مدرسة تيرانس للتعليم اللاهوتي والوعظ: تقدم برامج تعليمية متخصصة في اللاهوت والوعظ لتأهيل القساوسة والوعاظ. مركز القديسة فيرينا لتدريب التمريض: يختص بتدريب الكوادر الطبية والتمريضية لخدمة المجتمع. وبالإضافة إلى ذلك، توفر الكنيسة القبطية من خلال هذه الهيئات التعليمية بيئة تعليمية متكاملة تشمل التعليم النظري والعملي، مع التركيز على الهوية القبطية والثقافة المسيحية، مما يسهم في بناء جيل قادر على مواجهة تحديات العصر.